Welcome to the MapMan Family of Software Forum

Please do not hesitate to register and post your question.

Don't forget to subscribe to your posted message so you get notified on updates.
Every question you post will help others and or enhance the software!

Post a question,   post a bug!

Welcome to the MapMen Family of Software Forum Welcome to the MapMen Family of Software Forum

MapMan

Using MapMan

Aiheet
Aihe Merkitty asiattomaksi. Aloittaja Viestejä kertaa luettu Viimeisin viesti  
hormones Marie Claire Javelle 2 6633 Päiväys: 7.6.2013 14:10
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Brassica Mapping Prateek Tripathi 8 9160 Päiväys: 7.6.2013 14:02
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Maize gene ID instead of transcript ID? Odottaa vastausta Stefanie Dukowic-Schulze 5 13735 Päiväys: 5.6.2013 17:12
Kirjoittaja: Stefanie Dukowic-Schulze
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
rice mapping Odottaa vastausta he d l 3 9031 Päiväys: 1.5.2013 13:33
Kirjoittaja: ritushree jain
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Please import the newest mapping of Populus trichocarpa v3 to MapMan Hao Jiang 5 10088 Päiväys: 22.4.2013 15:23
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Need help with Mapman annotation using Mercator Yuhong Tang 2 7237 Päiväys: 22.4.2013 11:47
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mapping of TC´s (Tentative Contigs) in Oryza sativa Ratkaistu Martin Hinrichs 14 24156 Päiväys: 12.4.2013 11:26
Kirjoittaja: Martin Hinrichs
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Using Mercator pipeline with a de novo assembly Jose Gonzalez 7 10020 Päiväys: 10.4.2013 17:19
Kirjoittaja: Jose Gonzalez
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mapping for metabolite download Mariana Sotelo Sotelo 4 9098 Päiväys: 10.4.2013 16:15
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
brassica napus mapping vaji safavi 2 7432 Päiväys: 10.4.2013 16:11
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
General array import problems Odottaa vastausta marco p 2 6685 Päiväys: 10.4.2013 16:08
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Phaseolus vulgaris phytozome release Odottaa vastausta Craig R Yendrek 2 7121 Päiväys: 10.4.2013 16:05
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Soybean: Adding Bins for updated models (Phytozome v 1.1) Ratkaistu waseem haider 6 14586 Päiväys: 10.4.2013 16:03
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Adding Arabidopsis Flowering Gene Network waseem haider 3 7756 Päiväys: 8.4.2013 20:37
Kirjoittaja: waseem haider
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Aquiring counts from BAM files generated using other tools Richard John Barker 2 7591 Päiväys: 8.4.2013 18:01
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mercator error Kameswara Rao Kottapalli 2 6873 Päiväys: 4.4.2013 12:03
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Importing the sequence reads by SOLiD to MapMan Odottaa vastausta Rahim ahmadvand 14 16689 Päiväys: 4.4.2013 11:49
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Importing BAM files to RobinA Odottaa vastausta Megan Osborne 2 7236 Päiväys: 22.2.2013 10:54
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
an error of RobiNA new start Odottaa vastausta Jin Huang 2 6679 Päiväys: 15.2.2013 12:28
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Request mapping of Tomato gene ID annotated from genome Soon-ju Park 5 10912 Päiväys: 5.2.2013 14:59
Kirjoittaja: Justin Lashbrooke
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Grouping biological repeats for DEseq using the RobiNA GUI Ratkaistu Richard John Barker 10 17891 Päiväys: 5.2.2013 11:21
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
RNA seq Arabidopsis thaliana Odottaa vastausta Daniel Caudepon 3 9402 Päiväys: 25.1.2013 17:08
Kirjoittaja: Daniel Caudepon
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
edgeR error Odottaa vastausta Pedro Soares Castro 2 14034 Päiväys: 22.1.2013 14:04
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
How to save the whole data on a click Odottaa vastausta Clara Rodriguez 7 9946 Päiväys: 16.1.2013 10:21
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Poplar Data Format Ratkaistu Eric Lloyd Patterson 2 5852 Päiväys: 10.1.2013 11:53
Kirjoittaja: Björn Usadel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mercator data file generated but not able to load on mapman Apurva Bhargava 2 6978 Päiväys: 9.1.2013 10:35
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Adjusting scale values and/or colour Ratkaistu A Weijn 2 6192 Päiväys: 3.1.2013 16:38
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mt_Mt3.5_0411 file Lee FANCY 2 5372 Päiväys: 3.1.2013 10:21
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
uploading data to Mercator Odottaa vastausta Rahim ahmadvand 2 6690 Päiväys: 2.1.2013 13:00
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Grape Nimblegen Array Ratkaistu Daniel William Hopper 2 6996 Päiväys: 23.12.2012 14:03
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
How to import the mapping files in mapman Jian gao 2 11237 Päiväys: 20.12.2012 8:48
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Error loading mapping file Odottaa vastausta Ram Kumar Basnet 3 7545 Päiväys: 14.12.2012 18:17
Kirjoittaja: Ram Kumar Basnet
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
create mapping file for new species Odottaa vastausta kaat de cremer 7 10444 Päiväys: 4.12.2012 14:32
Kirjoittaja: kaat de cremer
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
miscellaneous group Odottaa vastausta Clara Rodriguez 3 5742 Päiväys: 13.11.2012 12:08
Kirjoittaja: Clara Rodriguez
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Metabolome from METLIN into Mapman Rosa m Rivero 3 7917 Päiväys: 13.11.2012 11:35
Kirjoittaja: Rosa m Rivero
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Adapter sequences Odottaa vastausta David S Pitcher 2 9231 Päiväys: 8.11.2012 14:31
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Add bin to pathway Aysha Kiran 2 7959 Päiväys: 5.11.2012 11:00
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Robin: Signal intensity Thana K Khan 1 4276 Päiväys: 1.11.2012 17:10
Kirjoittaja: Thana K Khan
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Robin critical message Ratkaistu Thana K Khan 3 6921 Päiväys: 1.11.2012 15:37
Kirjoittaja: Thana K Khan
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
customized species mapping Eli oo Reuveni 4 6214 Päiväys: 1.11.2012 8:34
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Venn diagrams show the same number of genes Eva Lima Oliveira 6 10574 Päiväys: 24.10.2012 11:26
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Add new species for annotations. Eva Lima Oliveira 2 5099 Päiväys: 24.10.2012 11:10
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mercator Ratkaistu emilie villar 11 16780 Päiväys: 15.10.2012 18:48
Kirjoittaja: Happyfly NN
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
How to use Mapman? Ratkaistu Mohammad Salehin 3 12502 Päiväys: 11.10.2012 7:58
Kirjoittaja: Mohammad Salehin
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Maize Chromosomal View Odottaa vastausta Victor Manuel Rodriguez 2 5673 Päiväys: 8.10.2012 14:52
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Installing Pageman java problem Ratkaistu Estelle Giraud 2 8643 Päiväys: 7.10.2012 12:14
Kirjoittaja: Björn Usadel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Pageman- data compare w/ published lists of diff. expressed genes Ratkaistu Chris Rock 4 8002 Päiväys: 24.9.2012 6:33
Kirjoittaja: Chris Rock
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mercator is not working Ratkaistu Chunying Kang 2 5765 Päiväys: 27.8.2012 11:51
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
retrieve previous configuration Ratkaistu michael mazeron 2 5665 Päiväys: 24.8.2012 15:21
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Tomato EUTOM3 annotation Catherine Martel 2 5613 Päiväys: 24.8.2012 15:13
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Identifier for rice gene Dear tinyfish 4 9305 Päiväys: 23.8.2012 11:54
Kirjoittaja: Julian Kwoczek
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
get error on upload maize map file Odottaa vastausta Tao Zuo 2 5956 Päiväys: 23.8.2012 9:51
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Using MapMan for Medicago RNAseq data visualization Céline camps 4 10158 Päiväys: 16.8.2012 10:48
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Looking for BINs file (no subBINs) and their description Sukhwinder Singh Aulakh 2 5985 Päiväys: 3.8.2012 11:38
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
problem with uploading Zea may mapping file into Mapman 3.5beta thomas keat teoh 2 6088 Päiväys: 11.7.2012 13:59
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
MapMan and de-novo genome annotations (GO, KEGG) Odottaa vastausta Alfons Weig 1 5716 Päiväys: 10.7.2012 15:58
Kirjoittaja: Alfons Weig
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mercator Kameswara Rao Kottapalli 2 5082 Päiväys: 21.6.2012 19:16
Kirjoittaja: Kameswara Rao Kottapalli
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Trimmomatic adapter clipping problem Odottaa vastausta Helen Hipperson 1 5791 Päiväys: 15.6.2012 17:52
Kirjoittaja: Helen Hipperson
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Characters or Font Ratkaistu khalil k kane 2 7187 Päiväys: 6.6.2012 22:23
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
QC process failed! Exit code:133 Ratkaistu Eva Lima Oliveira 11 20412 Päiväys: 6.6.2012 18:21
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
multiple test correction on ORA Bianyun Yu 3 5967 Päiväys: 30.5.2012 0:25
Kirjoittaja: Bianyun Yu
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
MapMan update-TAIR 10 Ratkaistu vaji safavi 2 6658 Päiväys: 21.5.2012 12:13
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mapping files for Sorghum Ratkaistu Jose Gonzalez 2 6282 Päiväys: 21.5.2012 12:07
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
When I use Cromosomal View Ratkaistu Rita Kumari 4 10504 Päiväys: 20.5.2012 21:01
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Scaffold to Mapman data transfer Odottaa vastausta Sowmya Subramanian 2 5070 Päiväys: 20.5.2012 20:41
Kirjoittaja: Björn Usadel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Problem installing MapMan with Red Hat Enterprise Linux Ratkaistu Erin Doyle 3 6943 Päiväys: 8.5.2012 21:08
Kirjoittaja: Erin Doyle
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Uploading data Odottaa vastausta Philip Young 7 10768 Päiväys: 3.5.2012 16:06
Kirjoittaja: Philip Young
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
chromosome mapping Mattia Donà 3 6261 Päiväys: 11.4.2012 11:44
Kirjoittaja: Mattia Donà
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
creating bins for using mapman Ratkaistu bindu - vasuki 2 8234 Päiväys: 10.4.2012 13:55
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Metabolism-overview: Error parsing bin code Ratkaistu vaji safavi 2 6715 Päiväys: 10.4.2012 13:53
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Arabidopsis chloroplast gene mapping file Ratkaistu Yuqing Xiong 5 7634 Päiväys: 3.4.2012 17:46
Kirjoittaja: Yuqing Xiong
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
alga RNA seq mapping Bill Nelson 2 5565 Päiväys: 29.3.2012 22:28
Kirjoittaja: Axel Nagel
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mapman license to a private company Rico Alvarez Caldo 3 8864 Päiväys: 14.3.2012 15:53
Kirjoittaja: Rico Alvarez Caldo
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
Mapping file for Affymetrix Brassica Exon 1.0 ST Array Ratkaistu Martijn Fiers 13 17224 Päiväys: 2.2.2012 11:54
Kirjoittaja: Marc Lohse
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)
MapManWeb Ratkaistu Wimalanathan Kokulapalan 4 5734 Päiväys: 31.1.2012 4:01
Kirjoittaja: Wimalanathan Kokulapalan
RSS (avautuu uuteen ikkunaan)