Welcome to the MapMan Family of Software Forum

Please do not hesitate to register and post your question.

Don't forget to subscribe to your posted message so you get notified on updates.
Every question you post will help others and or enhance the software!

Post a question,   post a bug!

Welcome to the MapMen Family of Software Forum Welcome to the MapMen Family of Software Forum

MapMan

Using MapMan

Threads
Thread Kennzeichnung Angefangen von Beiträge Aufrufe Letzter Beitrag  
Brassica napus mappings Geklärt Henrik U Stotz 2 7672 Datum: 30.08.16 09:19
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
editing mode in pageman Geklärt Toshi Foster 2 7172 Datum: 30.08.16 09:18
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
import custom pathway file Warte auf Antwort Wolfgang Mark Hoehenwarter5 1 5714 Datum: 25.05.16 16:06
Von: Wolfgang Mark Hoehenwarter5
RSS (Öffnet neues Fenster)
taking a long time to set up workflow. Warte auf Antwort koushik ponnanna 1 5615 Datum: 30.04.16 05:04
Von: koushik ponnanna
RSS (Öffnet neues Fenster)
Medicago truncatula Marie-Laure Erffelinck 3 9057 Datum: 28.04.16 15:02
Von: Marie-Laure Erffelinck
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator Status: QUEUED Warte auf Antwort vit heven 3 7611 Datum: 25.04.16 20:24
Von: vit heven
RSS (Öffnet neues Fenster)
Graphips Lilian Rocio Duplat 3 7498 Datum: 19.04.16 04:00
Von: Lilian Rocio Duplat
RSS (Öffnet neues Fenster)
Eucalyptus grandis Analysis Camilo Elber Vital 2 6501 Datum: 22.03.16 15:37
Von: edson mario silva
RSS (Öffnet neues Fenster)
RobiNA cannot create a new project Stokes S. Baker 6 10514 Datum: 13.03.16 21:03
Von: Stokes S. Baker
RSS (Öffnet neues Fenster)
Soybean updated model (Gmax_275) Ivana Sabljic 1 5318 Datum: 09.03.16 15:49
Von: Ivana Sabljic
RSS (Öffnet neues Fenster)
overlapping bins in pathways Warte auf Antwort Melinda Ruth Vinqvist-Tymchuk 3 7329 Datum: 19.02.16 19:20
Von: Melinda Ruth Vinqvist-Tymchuk
RSS (Öffnet neues Fenster)
How i can get the input file for HiSeq data? Warte auf Antwort Marco Tulio Solano 4 9831 Datum: 31.12.15 13:34
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mapping file - Brassica napus 4x44k Agilent microarray Warte auf Antwort Sidsel Hagen 1 5382 Datum: 07.12.15 19:11
Von: Sidsel Hagen
RSS (Öffnet neues Fenster)
package "mapping, pathway and experiment" Warte auf Antwort edson mario silva 1 5115 Datum: 03.12.15 14:19
Von: edson mario silva
RSS (Öffnet neues Fenster)
how to define gene supset with filter? Warte auf Antwort Björn Grübler 1 5912 Datum: 25.11.15 16:34
Von: Björn Grübler
RSS (Öffnet neues Fenster)
whole genome data or specific gene list? Warte auf Antwort Björn Grübler 3 7543 Datum: 25.11.15 14:32
Von: Björn Grübler
RSS (Öffnet neues Fenster)
Is Mercator working? Diana Branco 3 7489 Datum: 07.10.15 18:29
Von: Diana Branco
RSS (Öffnet neues Fenster)
Cannot upload my excel data to test my gene list for enrichment analysis Daniel de Vega 1 4914 Datum: 01.10.15 17:39
Von: Daniel de Vega
RSS (Öffnet neues Fenster)
FDR corrected p-value on PageMan Warte auf Antwort Ima Mulyama Zainuddin 4 11607 Datum: 13.08.15 11:50
Von: Ima Mulyama Zainuddin
RSS (Öffnet neues Fenster)
Venn diagram with barley RNA seq data Warte auf Antwort Simone Koar 2 8366 Datum: 27.07.15 16:15
Von: Ima Mulyama Zainuddin
RSS (Öffnet neues Fenster)
Saccharum officinarum reference genome Daniel Renato 1 5782 Datum: 22.07.15 23:08
Von: Daniel Renato
RSS (Öffnet neues Fenster)
Problem about "pathway dose not show any of the bins" Warte auf Antwort Jiayi Sun 2 7601 Datum: 21.07.15 10:53
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
Can not RUN MAPMAN new version! Warte auf Antwort Fernanda Salvato 2 6615 Datum: 13.07.15 12:03
Von: Marie Bolger
RSS (Öffnet neues Fenster)
RobiNA: Issue on importing count data Warte auf Antwort Stokes S. Baker 1 5160 Datum: 06.07.15 22:04
Von: Stokes S. Baker
RSS (Öffnet neues Fenster)
Problems with Setaria italica ID Warte auf Antwort Luciana Deca Nogueira 4 10004 Datum: 05.07.15 23:27
Von: Luciana Deca Nogueira
RSS (Öffnet neues Fenster)
Presence of redundant IDS Warte auf Antwort Ashish Kumar Pathak 2 7527 Datum: 05.07.15 20:08
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
Grey box in PageMan Warte auf Antwort Jing Fan 3 8504 Datum: 26.06.15 06:55
Von: Jing Fan
RSS (Öffnet neues Fenster)
metabolite mapping Geklärt Pushpa D doddaraju 2 7821 Datum: 19.06.15 10:26
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
integrate mapman into web Warte auf Antwort Salim Bougouffa 2 7683 Datum: 14.06.15 18:35
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
PageMan ORA cut off value Warte auf Antwort Motlalepula Pholo 3 8344 Datum: 14.06.15 18:34
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mapping with own reference Warte auf Antwort Enzo Klein 5 7659 Datum: 26.05.15 09:43
Von: Michal Sharabi
RSS (Öffnet neues Fenster)
IDENTIFIER differs Warte auf Antwort Tao Song 3 7250 Datum: 11.05.15 16:08
Von: Marie Bolger
RSS (Öffnet neues Fenster)
Problem with starting up RobiNA Warte auf Antwort Matt Escobar 1 5189 Datum: 26.04.15 23:12
Von: Matt Escobar
RSS (Öffnet neues Fenster)
mapping file for soybean that has transcripts and metabolites Warte auf Antwort Eva Collakova 3 7329 Datum: 01.04.15 06:11
Von: Jesson Tian
RSS (Öffnet neues Fenster)
RobiNA Exit Code 1 Warte auf Antwort Sidsel Hagen 1 5402 Datum: 16.03.15 16:26
Von: Sidsel Hagen
RSS (Öffnet neues Fenster)
Arabidopsis mapping Warte auf Antwort Lilian Rocio Duplat 1 5091 Datum: 14.03.15 22:38
Von: Lilian Rocio Duplat
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mapping file for NCBI GI ids of proteins Warte auf Antwort Pooja pra sethiya 2 8463 Datum: 13.03.15 09:22
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
Overrepresentation Analysis dong li 3 8924 Datum: 04.03.15 18:29
Von: dong li
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator fatal error Warte auf Antwort Catherine Tetard-Jones 6 8807 Datum: 02.03.15 12:19
Von: Marie Bolger
RSS (Öffnet neues Fenster)
MapMan with Tomato ITAG 2.4 Warte auf Antwort Gilgi Friedlander 2 10154 Datum: 25.02.15 12:05
Von: Robin Gort
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator works but data files don`t map back Warte auf Antwort RAFAEL BORGES DA SILVA VALADARES 9 12628 Datum: 10.02.15 20:49
Von: RAFAEL BORGES DA SILVA VALADARES
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator problems Warte auf Antwort Adriana Ravagnani 6 8528 Datum: 06.02.15 11:08
Von: Marie Bolger
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator Job is queued Bhakti Milind Limaye 2 6809 Datum: 06.02.15 09:36
Von: Marie Bolger
RSS (Öffnet neues Fenster)
de novo Transcriptome assembly Warte auf Antwort Jose Manuel Monroy Kuhn 2 6951 Datum: 30.01.15 10:09
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
Biotic Stress Overview Warte auf Antwort Seowoo Kim 1 6010 Datum: 12.01.15 07:29
Von: Seowoo Kim
RSS (Öffnet neues Fenster)
KEGG pathway analysis jingyu peng 1 7992 Datum: 18.12.14 06:37
Von: jingyu peng
RSS (Öffnet neues Fenster)
Maize mapping file phytozome 9.0 Warte auf Antwort Nicola Carraro 1 6064 Datum: 26.11.14 23:29
Von: Nicola Carraro
RSS (Öffnet neues Fenster)
Adding data to Mapping Files Sumona Mitra 1 4636 Datum: 17.11.14 13:06
Von: Sumona Mitra
RSS (Öffnet neues Fenster)
Low number of genes displayed from splice variants mapped to TAIR database Jiameng Wang 1 4948 Datum: 14.11.14 08:33
Von: Jiameng Wang
RSS (Öffnet neues Fenster)
large dataset Geklärt Sara Torre 2 7398 Datum: 11.11.14 11:55
Von: Marie Bolger
RSS (Öffnet neues Fenster)
ImageAnnotator Geklärt Sumona Mitra 4 7892 Datum: 05.11.14 13:45
Von: Sumona Mitra
RSS (Öffnet neues Fenster)
Phytozome 10 Soybean Mappings Warte auf Antwort Michelle Graham 1 5923 Datum: 23.10.14 21:02
Von: Michelle Graham
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator Error Andrea Braeutigam 4 9016 Datum: 20.10.14 15:54
Von: Andrea Braeutigam
RSS (Öffnet neues Fenster)
potato Warte auf Antwort anupama singh 1 5712 Datum: 18.10.14 12:27
Von: anupama singh
RSS (Öffnet neues Fenster)
Data normalization in RobiNA Warte auf Antwort Karin tole 3 7851 Datum: 08.10.14 16:44
Von: Karin tole
RSS (Öffnet neues Fenster)
Probe ID vs BIN Warte auf Antwort Mariana Emiliozzi 3 7884 Datum: 01.10.14 10:07
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
[Help] Error of Mercator Geklärt songling bai 10 28922 Datum: 25.09.14 12:22
Von: Marie Bolger
RSS (Öffnet neues Fenster)
new mapping file Warte auf Antwort liao xinhui liao 5 8802 Datum: 25.09.14 09:42
Von: liao xinhui liao
RSS (Öffnet neues Fenster)
mapman 3.6 can not installed in mac os x 10.9 Zhuo Shen 1 5530 Datum: 21.09.14 04:03
Von: Zhuo Shen
RSS (Öffnet neues Fenster)
Phaseolus vulgaris map Paula R Oblessuc 1 4903 Datum: 18.09.14 02:06
Von: Paula R Oblessuc
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator output file Martin Thomas 2 6430 Datum: 10.09.14 13:28
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator" Fatal" Upload Error Warte auf Antwort Knut Erik Tollefsen 1 4859 Datum: 05.09.14 22:21
Von: Knut Erik Tollefsen
RSS (Öffnet neues Fenster)
Not all mapped data points are visible in the Pathway Geklärt Maria Veronica Beligni 3 7165 Datum: 01.09.14 15:07
Von: Maria Veronica Beligni
RSS (Öffnet neues Fenster)
The identities of P. trichocarpa_v3.0_210 peptide hao chen 1 4987 Datum: 30.08.14 05:40
Von: hao chen
RSS (Öffnet neues Fenster)
Select the data sets to do something? Junli Zhang 1 4963 Datum: 30.08.14 02:11
Von: Junli Zhang
RSS (Öffnet neues Fenster)
Add new Citrus sinensis peptide sequence into mapping file Warte auf Antwort Junli Zhang 1 5593 Datum: 27.08.14 20:53
Von: Junli Zhang
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mapping file for Sorghum bicolor v2.1 Warte auf Antwort Roel Rabara 1 5317 Datum: 14.08.14 00:39
Von: Roel Rabara
RSS (Öffnet neues Fenster)
Mercator job queued Oliver Berkowitz 5 7532 Datum: 22.07.14 13:53
Von: Adriana Ravagnani
RSS (Öffnet neues Fenster)
How to arrange RNA seq data for Mapman Geklärt Hifzur Rahman 3 7802 Datum: 03.07.14 13:12
Von: Hifzur Rahman
RSS (Öffnet neues Fenster)
Can Mapman web be integrated ? Shrey Muk 1 5032 Datum: 27.06.14 23:30
Von: Shrey Muk
RSS (Öffnet neues Fenster)
Functional assignament to unknown proteins Warte auf Antwort Juan Pierella 1 4709 Datum: 18.06.14 12:16
Von: Juan Pierella
RSS (Öffnet neues Fenster)
MapMan for potato iTAG1.0 Warte auf Antwort Helen Tai 1 4984 Datum: 05.06.14 22:55
Von: Helen Tai
RSS (Öffnet neues Fenster)
Small DEGs in RobiNA Warte auf Antwort jinhyoung Kim 5 8761 Datum: 30.05.14 03:13
Von: jinhyoung Kim
RSS (Öffnet neues Fenster)
edgeR error jinhyoung Kim 3 6763 Datum: 29.05.14 23:26
Von: jinhyoung Kim
RSS (Öffnet neues Fenster)
FATAL exception during Mercator upload Warte auf Antwort Andrea Braeutigam 2 6531 Datum: 29.05.14 17:54
Von: Björn Usadel
RSS (Öffnet neues Fenster)